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10歳でウェールズにあるメルディアナ魔法学校を首席で卒業した天才少年のネギ（ネギ・スプリングフィールド）が、「立派な魔法使い（マギステル・マギ）」になるための修行として与えられた課題は、日本の学校で先生をすることだった。教師として赴任したネギは正体を隠したまま2年A組の31人の生徒と出会った。何人かの生徒はネギにさまざまな理由で好意を持ち、たびたび争奪戦が繰り広げられた。また、ネギは教師としても魔法使いとしてもまだ未熟で、A組では騒動が絶えなかった。また、ネギには行方不明となっている父親を捜すという目的があり、ネギの前には敵が現れ、ネギの正体を知った生徒は魔法を習得するなどしてネギを助けようとする。一方で、ネギは生徒に迷惑をかけたくなくて一人で危険に立ち向かおうとする。
（出典：Wikipedia）