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文武両道・容姿端麗・質実剛健・才色兼備・有言実行...の完璧超人である箱庭学園の1年生、黒神めだか。彼女は入学したてでありながらも、生徒会長選挙で大言壮語を放った結果、支持率98%で箱庭学園第98代生徒会長となる。 選挙戦での公約通り「目安箱」を設置し、その投書に書かれた案件を幼馴染の人吉善吉と共に解決していく。個性的な生徒揃いの箱庭学園であったが、生徒たちのトラブルを解決していくにつれ、次第に好評となった目安箱は、いつの間にか「めだかボックス」と呼ばれるようになる。
最初は2人だけだった生徒会も、いくつかの事件を解決していくうちに、柔道界のプリンス阿久根高貴、競泳部の守銭奴喜界島もがなといった個性ゆたかなメンバー達が揃っていく。
（出典：Wikipedia）